Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BccipQ9CWI3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms