Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Nek9Q8K1R7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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Nek9Q8K1R7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek9Q8K1R7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms