Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot7Q60809 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms