Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn34b4Q3V0X2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn34b4Q3V0X2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cldn34b4Q3V0X2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn34b4Q3V0X2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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