Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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VPS72Q15906 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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