Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HDAC1Q13547 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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