Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Mc1rQ01727 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mc1rQ01727 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms