Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1P55194 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1P55194 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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