Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms