Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Defa3P28310 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Defa3P28310 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms