Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxb7P09024 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb7P09024 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms