Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01853 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01853 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01853 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01853 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01853 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01853 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01853 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01853 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01853 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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