Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F3O00716 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F3O00716 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms