Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrit3W8DXL4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrit3W8DXL4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrit3W8DXL4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrit3W8DXL4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1250.3 ms