Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gria3Q9Z2W9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria3Q9Z2W9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria3Q9Z2W9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gria3Q9Z2W9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gria3Q9Z2W9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gria3Q9Z2W9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gria3Q9Z2W9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gria3Q9Z2W9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gria3Q9Z2W9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gria3Q9Z2W9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gria3Q9Z2W9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gria3Q9Z2W9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gria3Q9Z2W9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gria3Q9Z2W9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gria3Q9Z2W9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gria3Q9Z2W9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gria3Q9Z2W9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms