Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Crlf3Q9Z2L7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Crlf3Q9Z2L7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Crlf3Q9Z2L7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms