Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RfxankQ9Z205 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RfxankQ9Z205 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RfxankQ9Z205 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RfxankQ9Z205 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RfxankQ9Z205 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RfxankQ9Z205 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RfxankQ9Z205 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RfxankQ9Z205 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RfxankQ9Z205 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RfxankQ9Z205 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RfxankQ9Z205 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RfxankQ9Z205 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RfxankQ9Z205 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RfxankQ9Z205 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RfxankQ9Z205 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RfxankQ9Z205 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RfxankQ9Z205 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms