Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Nrf1Q9WU00 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Nrf1Q9WU00 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nrf1Q9WU00 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Nrf1Q9WU00 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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Nrf1Q9WU00 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nrf1Q9WU00 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nrf1Q9WU00 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nrf1Q9WU00 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nrf1Q9WU00 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Nrf1Q9WU00 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Nrf1Q9WU00 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Nrf1Q9WU00 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Nrf1Q9WU00 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Nrf1Q9WU00 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Nrf1Q9WU00 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Nrf1Q9WU00 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Nrf1Q9WU00 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Nrf1Q9WU00 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nrf1Q9WU00 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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