Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psma1Q9R1P4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma1Q9R1P4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms