Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BcamQ9R069 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BcamQ9R069 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BcamQ9R069 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcamQ9R069 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms