Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gkap1Q9JMB0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gkap1Q9JMB0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gkap1Q9JMB0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gkap1Q9JMB0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gkap1Q9JMB0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gkap1Q9JMB0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gkap1Q9JMB0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gkap1Q9JMB0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gkap1Q9JMB0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gkap1Q9JMB0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gkap1Q9JMB0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gkap1Q9JMB0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms