Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Efcc1Q9JJF6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Efcc1Q9JJF6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Efcc1Q9JJF6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Efcc1Q9JJF6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms