Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FliiQ9JJ28 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FliiQ9JJ28 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FliiQ9JJ28 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FliiQ9JJ28 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms