Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmbr1Q9JIT0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmbr1Q9JIT0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lmbr1Q9JIT0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbr1Q9JIT0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms