Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cxcl11Q9JHH5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cxcl11Q9JHH5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cxcl11Q9JHH5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cxcl11Q9JHH5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cxcl11Q9JHH5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cxcl11Q9JHH5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cxcl11Q9JHH5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms