Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Timp4Q9JHB3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Timp4Q9JHB3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Timp4Q9JHB3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms