Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pgpep1Q9ESW8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pgpep1Q9ESW8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pgpep1Q9ESW8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pgpep1Q9ESW8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pgpep1Q9ESW8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Pgpep1Q9ESW8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pgpep1Q9ESW8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pgpep1Q9ESW8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pgpep1Q9ESW8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pgpep1Q9ESW8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pgpep1Q9ESW8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pgpep1Q9ESW8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pgpep1Q9ESW8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgpep1Q9ESW8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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