Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ7

Rims2, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims2Q9EQZ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Rims2Q9EQZ7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Rims2Q9EQZ7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rims2Q9EQZ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rims2Q9EQZ7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rims2Q9EQZ7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rims2Q9EQZ7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rims2Q9EQZ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rims2Q9EQZ7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Rims2Q9EQZ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rims2Q9EQZ7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rims2Q9EQZ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rims2Q9EQZ7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Rims2Q9EQZ7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rims2Q9EQZ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms