Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tlr1Q9EPQ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlr1Q9EPQ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlr1Q9EPQ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms