Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trmt112Q9DCG9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trmt112Q9DCG9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trmt112Q9DCG9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt112Q9DCG9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt112Q9DCG9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt112Q9DCG9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt112Q9DCG9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt112Q9DCG9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Trmt112Q9DCG9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms