Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Riok3Q9DBU3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Riok3Q9DBU3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms