Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ftsj3Q9DBE9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ftsj3Q9DBE9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ftsj3Q9DBE9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ftsj3Q9DBE9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms