Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smco2Q9DA21 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smco2Q9DA21 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smco2Q9DA21 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms