Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hcfc2Q9D968 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hcfc2Q9D968 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hcfc2Q9D968 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms