Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifi35Q9D8C4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifi35Q9D8C4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifi35Q9D8C4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifi35Q9D8C4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifi35Q9D8C4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ifi35Q9D8C4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ifi35Q9D8C4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ifi35Q9D8C4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifi35Q9D8C4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms