Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capns2Q9D7J7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Capns2Q9D7J7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Capns2Q9D7J7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capns2Q9D7J7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.6 ms