Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clvs1Q9D4C9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clvs1Q9D4C9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clvs1Q9D4C9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms