Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Shisal2bQ9D1Y9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal2bQ9D1Y9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Shisal2bQ9D1Y9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms