Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Syf2Q9D198 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Syf2Q9D198 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Syf2Q9D198 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms