Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfc5Q9D0F6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc5Q9D0F6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc5Q9D0F6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms