Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab3bQ9CZT8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab3bQ9CZT8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab3bQ9CZT8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms