Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX48

Zcchc10, Zinc finger CCHC domain-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc10Q9CX48 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc10Q9CX48 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zcchc10Q9CX48 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zcchc10Q9CX48 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zcchc10Q9CX48 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zcchc10Q9CX48 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zcchc10Q9CX48 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zcchc10Q9CX48 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zcchc10Q9CX48 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zcchc10Q9CX48 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zcchc10Q9CX48 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zcchc10Q9CX48 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zcchc10Q9CX48 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zcchc10Q9CX48 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms