Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NubplQ9CWD8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NubplQ9CWD8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NubplQ9CWD8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NubplQ9CWD8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NubplQ9CWD8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NubplQ9CWD8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NubplQ9CWD8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NubplQ9CWD8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NubplQ9CWD8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NubplQ9CWD8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NubplQ9CWD8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 964.2 ms