Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mrpl49Q9CQ40 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mrpl49Q9CQ40 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mrpl49Q9CQ40 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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