Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ino80bQ99PT3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ino80bQ99PT3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80bQ99PT3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms