Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc4Q99PH1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc4Q99PH1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc4Q99PH1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc4Q99PH1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc4Q99PH1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc4Q99PH1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc4Q99PH1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc4Q99PH1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc4Q99PH1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc4Q99PH1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc4Q99PH1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc4Q99PH1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc4Q99PH1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc4Q99PH1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc4Q99PH1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc4Q99PH1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms