Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chmp1b1Q99LU0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chmp1b1Q99LU0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chmp1b1Q99LU0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms