Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim11aQ99J19 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim11aQ99J19 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms