Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ9

Prdm9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, mousemouse

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Length 843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm9Q96EQ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm9Q96EQ9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm9Q96EQ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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