Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Supt16hQ920B9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Supt16hQ920B9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt16hQ920B9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Supt16hQ920B9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms